วาฬสีน้ำเงิน เป็นแรงบันดาลใจที่ได้จาก ศาสตราจารย์ ดร.นพ.ประสิทธิ์ วัฒนาภา ที่ปรึกษาคณบดี คณะแพทยศาสตร์ศิริราชพยาบาล ที่มีความตั้งใจจะนำเอา “วาฬสีน้ำเงิน หรือ Blue Whale” มาเป็นสัญลักษณ์ของการจัดงาน MU Blue Night ในปี พ.ศ. 2563
วาฬสีน้ำเงินนับเป็นสัตว์ขนาดใหญ่ ที่มีความคล่องแคล่ว ว่องไว พร้อมฝ่ากระแสน้ำและทุกเกลียวคลื่นเพื่อจะออกไปค้นพบสิ่งใหม่ เป็นสัตว์ที่ไม่ว่าจะอยู่ที่ไหน มันสามารถอยู่เดี่ยว สามารถอยู่เป็นคู่ สามารถอยู่กันเป็นครอบครัว มีสายใยในฝูง เปรียบเสมือนมหาวิทยาลัยมหิดล ที่เป็นมหาวิทยาลัยขนาดใหญ่ ที่มีความรวดเร็วในการปรับตัวเพื่อรับการเปลี่ยนแปลงที่เกิดขึ้น และนำความเปลี่ยนแปลงที่ดีมาสู่สังคม และเสมือนชาวมหิดลที่ไม่ว่าจะอยู่ที่ไหน จะอยู่คนเดียว จะอยู่รวมกลุ่ม เรายังมีเครือข่าย และเรายังสามารถกลับมาอยู่ด้วยกันได้
วาฬสีน้ำเงินยังเป็นสัญลักษณ์ของสัตว์แห่งปัญญาและความฉลาด มีระบบการส่งและรับสัญญาณเสียงที่สะท้อนกลับมา (echo) ซึ่งใช้ในการสื่อสารกับกลุ่มวาฬ การรับรู้สภาพแวดล้อมรอบ ๆ ตัว และการหาอาหาร เป็นคุณลักษณะที่มหาวิทยาลัยอยากสร้างให้เครือข่ายของมหิดลแข็งแรง
